中國基因組科學資料中心 首公布新型冠狀病毒全基因組序列

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2019-nCoV新型冠狀病毒(簡稱:武漢肺炎)疫情擴散,在29日衛福部說明,已出現第八例確診病例;同時全球包含日本、韓國、泰國與法國等地都出現病例。現在中國的科學家公佈了其中5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。

中國的國家基因組科學資料中心(NGDC)提出的資訊顯示,1月26日,該中心收錄了由中國醫學科學院/北京協和醫學院病原生物學研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。

中國科學家陸續獲得的基因組序列一般遞交到全球流感序列資料庫(GISAID)和美國國家生物技術資訊中心(NCBI)的GenBank資料庫。

1月22日,國家基因組科學資料中心正式發佈2019新型冠狀病毒資訊庫。該庫整合了世界衛生組織(WHO)、中國疾病預防控制中心(CDC)、美國國家生物技術資訊中心、全球流感序列資料庫等機構公開發佈的冠狀病毒基因組序列資料。同時,對不同冠狀病毒株的基因組序列做了變異分析與展示。

2019新型冠狀病毒資訊庫基於不同參考基因組序列開展2019-nCoV病毒株基因組變異分析,並對結果進行了統計與視覺化展示。通過對全基因組序列相似性比較和變異位點分析,獲取2019-nCoV病毒株之間、2019-nCoV病毒株與SARS冠狀病毒以及與類SARS冠狀病毒蝙蝠株之間的變異程度、變異區域、變異堿基的詳細資訊。

針對2019-nCoV病毒株的基因組變異分析,可以為追溯病毒來源、追蹤病毒株變異路徑、防止新型冠狀病毒引發的疫情、治療病毒性肺炎提供重要基礎與決策。

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